Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms