Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aph1cQ9DCZ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms