Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan4Q9DCK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms