Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms