Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med29Q9DB91 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med29Q9DB91 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms