Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700016D06RikQ9DAA5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700016D06RikQ9DAA5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms