Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp12Q9D9M2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp12Q9D9M2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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