Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer4bQ9D9F7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer4bQ9D9F7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms