Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tvp23bQ9D8T4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms