Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin37Q9D8N6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lin37Q9D8N6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms