Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Jam3Q9D8B7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms