Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fip1l1Q9D824 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fip1l1Q9D824 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms