Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lysmd2Q9D7V2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lysmd2Q9D7V2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms