Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fundc2Q9D6K8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms