Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb8Q9D6J5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb8Q9D6J5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb8Q9D6J5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb8Q9D6J5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms