Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930556J24RikQ9D4U7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms