Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Erich6bQ9D4S6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Erich6bQ9D4S6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms