Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clvs1Q9D4C9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms