Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmntd1Q9D4C1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmntd1Q9D4C1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms