Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms