Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag1Q9D3E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stag1Q9D3E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stag1Q9D3E6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms