Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D2Q3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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