Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc6bQ9D289 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc6bQ9D289 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms