Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nol3Q9D1X0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms