Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18l2Q9D174 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ss18l2Q9D174 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ss18l2Q9D174 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18l2Q9D174 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ss18l2Q9D174 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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