Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm12Q9D0R8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm12Q9D0R8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms