Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pbdc1Q9D0B6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pbdc1Q9D0B6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms