Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CenpnQ9CZW2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CenpnQ9CZW2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms