Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmss1Q9CZT6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms