Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shmt2Q9CZN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shmt2Q9CZN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms