Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc77Q9CZH8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc77Q9CZH8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms