Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl35Q9CZ49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl35Q9CZ49 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms