Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nip7Q9CXK8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms