Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd12Q9CWU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd12Q9CWU0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms