Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NubplQ9CWD8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NubplQ9CWD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms