Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smc3Q9CW03 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smc3Q9CW03 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms