Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CRC3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CRC3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CRC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms