Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rer1Q9CQU3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms