Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gkn2Q9CQS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms