Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PsenenQ9CQR7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsenenQ9CQR7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms