Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms