Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921530L21RikQ9CQ47 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms