Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp3Q9CQ10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp3Q9CQ10 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp3Q9CQ10 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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