Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12aQ99PQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12aQ99PQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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