Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cep41Q99NF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms