Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf34Q99KR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf34Q99KR6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms