Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf19Q99KP6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf19Q99KP6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms