Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Reep3Q99KK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms