Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ubxn2aQ99KJ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2aQ99KJ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms