Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TrabdQ99JY4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrabdQ99JY4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrabdQ99JY4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms